Le Secrétariat Général est placé sous l’autorité d’un Secrétaire Général, principal collaborateur du Ministre qui suit l’instruction des affaires du Département et reçoit du Ministre les délégations de signature nécessaires.

 A ce titre il :

 
- coordonne l’action de l’Administration Centrale et des services déconcentrés du Ministère et tient à cet effet des réunions de coordination dont il adresse le procès-verbal au Ministre ;
- définit et codifie les procédures internes au Ministère ;
- veille à la formation permanente du personnel et organise, sous l’autorité du Ministre, des séminaires et des stages de recyclage de perfectionnement ou de spécialisation ;
- suit, le cas échéant, l’action des services rattachés dont il approuve le programme d’action et reçoit les comptes rendus d’activités ;
- veille à la célérité dans le traitement des dossiers, centralise les archives et gère la documentation du Ministère.

 En cas d’absence ou d’empêchement du Secrétaire Général, le Ministre désigne un Directeur pour assurer l’intérim.
Sont rattachés au Secrétariat Général :

 - la Division des Affaires Juridiques ;
- la Cellule des Etudes, de la Planification et de la Coopération ;
- la Cellule de Suivi ;
- la Cellule de Communication ;
- la Cellule Informatique et des Statistiques ;
- la Cellule de Traduction ;
- la Sous-direction de l’Accueil, du Courrier et de Liaison ;
- le Service de la Documentation et des Archives.